微孔草分布于陕西西南部，甘肃、青海、四川西部、云南西北部（中甸以北）、西藏东部和南部。
微孔草生海拔3000-4500米（在青海东部和甘肃一带海拔为2000-3000米，在陕西西南部低达1900米）山坡草地、灌丛下、林边、河边多石草地，田边或田中。
微孔草在锡金、尼泊尔、不丹和印度（东北部）也有分布。
