小叶紫檀在3-5月生长旺盛期修剪盆景比较合适，需先将枝干培养到合适的粗度，才能够进行修剪，修剪后的枝条可以用作扦插。小叶紫檀对生长势强的枝芽可修剪，已成熟的小叶紫檀造型期间，等枝干培养到粗度适合时，全部剪掉一段，然后等它生长出来再继续剪，如此往复。
小叶紫檀修剪要慎重，因为它生长极其缓慢，百年成材，十分珍贵，因此平时不建议任意修剪。
